souche
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S : AP – https://www.aquaportail.com/definition-3276-souche.html (consulté le 20.06.2021) ; INSERM – https://www.inserm.fr/information-en-sante/dossiers-information/resistance-antibiotiques (consulté le 20.06.2021).

N : 1. Fin XIes. çoche « partie du tronc qui reste en terre après qu’on a coupé l’arbre » (Raschi, Gl., éd. A. Darmesteter et D. S. Blondheim, t. 1, 218)] ; 1176-1181 çoche (Chrétien de Troyes, Chevalier Lion, éd. M. Roques, 290) ; 1178 çouche (Renart, éd. M. Roques, 13137) ; 1964 bactériol. souche microbienne (Lar. encyclop.).
2. Population virale qui a des propriétés biologiques distinctes, notamment antigéniques.
3. Pour chaque espèce de virus, il existe une souche de référence correspondant à la première description du virus, comparable aux souches sauvages isolées au cours du temps, dont certaines peuvent être à l’origine d’une épidémie. Il existe aussi des souches cultivées. Les sources d’un même virus peuvent être plus ou moins virulentes.
Dans le cas de l’influenzavirus, l’apparition de nouvelles souches virales se fait par dérive antigénique ou par cassure antigénique. L’identification des souches est nécessaire aux autorités sanitaires pour mettre au point traitements et vaccins, ces derniers étant basés sur plusieurs souches.
4. Sous-groupe d’une espèce de virus ayant des caractéristiques génétiques qui lui sont propres.
Phraséologie : souche virale dominante, souche virale initiale, souche virale de référence.
5. souche type : Souche, généralement unique, utilisée pour décrire une espèce de bactérie selon le code international de nomenclature bactérienne.
Elle est souvent désignée par le nom de la collection qui la conserve et le numéro de son catalogue. Ex. E. coli ATCC 11775.

S : 1. CNRTL – https://www.cnrtl.fr/definition/souche (consulté le 20.06.2021). 2 et 3. GDT – http://gdt.oqlf.gouv.qc.ca/ficheOqlf.aspx?Id_Fiche=26558172 (consulté le 20.06.2021). 4. TERMIUM PLUS – https://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-eng.html?lang=eng&i=1&srchtxt=strain&codom2nd_wet=1#resultrecs (consulté le 20.06.2021). 5. DAM – https://dictionnaire.academie-medecine.fr/index.php?q=souche&page=1 (consulté le 20.06.2021).

SYN : souche virale, souche de virus. (en fonction du contexte)

S : TERMIUM PLUS – https://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-eng.html?lang=eng&i=1&srchtxt=strain&codom2nd_wet=1#resultrecs (consulté le 20.06.2021) ; GDT – http://gdt.oqlf.gouv.qc.ca/ficheOqlf.aspx?Id_Fiche=26558172 (consulté le 20.06.2021).

RC : bactérie, maladie, souche cellulaire, virus.